Jalgpalliklubi Lootos ajalugu algab aastast 1994. Põlva jalgpalli ajalugu aga ulatub enam kui 35 aasta taha.

Põlvamaa jalgpalli juured ulatuvad aastasse 1979, kui esimest korda mängiti  Põlvas Põlva Rajooni RSN Täitevkomitee rändkarikale. Esimeseks karikavõitjaks tuli Põlva MEK-i võistkond. Suurim väravakütt oli Viktor Kass 8 väravaga. Meistrivõistlustest võttis osa 10 võistkonda. Järgmisel, olümpia aastal tuli rajooni meistriks Rajooni Täitevkomitee võistkond. Meistrivõistlustel osalesid järgmised võistkonnad: Värska, Mikitamäe, Räpina, EPT, KEK, MEK, Täitevkomitee võistkond, Piimakombinaat, Põlva Kolhoos, Võhandu Sovhoos. Tolleaegsetel ettevõtetel oli auasi omada jalgpallivõistkonda ja osaleda rajooni meistrivõistlustel. Tänastel Põlvamaa ettevõtetel oleks nii mõndagi meie ühisest spordiloost õppida ja anda oma panus, et kas või maakonna karikavõistlustel oma jalgpallimeeskonda omada. Rajooni esimesed meistrivõistlused polnud siiski päris algus. Põlva jalgpallitraditsioonidele pandi alus hoopis saunalaval. Kord võtsid saunalaval mõõtu Põlva MEK-i tolleaegne juhataja Mart Keek ja Põlva EPT peainsener Elmo Hainsoo. Kaks kanget seltsimeest vedasid saunalaval kihla, kumma ettevõtte mehed on vägevamad jalgpallurid. Otsustati, et kolme nädala pärast toimub jalgpallilahing, kus siis tehakse sotid klaariks. Töötajad said korralduse meeskonnad moodustada ja karmi kohustuse kõvasti trenni teha. Oli ju ikkagi ettevõtete au mängu pandud ja kumbki pool ei tahtnud kaotajaks jääda. Keek lubas väravalööjatele iga löödud värava eest ühe päeva lisapuhkust ja oma sõna ta pidas, väravalööjad ka oma lisapuhkepäevad said. Jalgpalliväljak valmistati ette ühiselt, mehed said selleks lausa vabad päevad. Jalgpalliväravad tehti MEK-is. Mäng algas üllatusega. Saunalaval oldi veel milleski kokkulepitud, nimelt pidid mängu algatajad ise oma võistkonna väravasuul seisma. Mart Keek oli aga sõnast taganenud ja pannud enda asemele oma autojuhi, samas kui Põlva EPT väravas seisis Elmo Hainsoo isiklikult. Mängust enesest mäletab Alar Kõiv seda, et pusimist oli palju ja meeskonnad rakendasid kõiki õuejalgpallis omandatud tehnikaid ja võtteid. Domineeriv pool mängus oli siiski MEK-i võistkond, kes tulemusega 4:1 Põlva esimese jalgpallilahingu ka võitis. Võitja meeskonnas mängisid Vladimir Zidra, Gennadi Pedras, Ülo Toomet, Vladimir El, Illar Tiisvend, Alar Kõiv (lõi mängus 2 väravat),Jaan Järvela, Evgeni Kuris, Arend Pedras, Agu Reedi, Ivan El, Aivar Käis ja Gainer El. Meistrivõistlustel osalevatel võistkondadel oli ainukesena treener Täitevkomitee võistkonnal. Treeneriks oli Helmut Sooberg, kellest sai ühtlasi esimene Põlva Rajooni esindusvõistkonna peatreener. Põlvamaa seni ainuke Eesti meeste jalgpallimeistrivõistluste medaliomanik Viktor Kass meenutab: „Tolleaegse rajooni spordikomitee esimehe Ants Maistega eesotsas organiseeriti rajooni jalgpalli meistrivõistlused. Suurepärane uus staadion oli olemas, tulihingeline jalgpalliveteran/treener Helmut Sooberg ja rida endiseid spordimehi. Ise olin 10-kond aastat jalgpalliprofessionaal Tartu Katseremonditehase meeskonnas väravavahina (1968. a saavutasime ENSV meistriliigas pronksmedalid, mis on tänini viimased kogu Lõuna Eestis).“ Viktor Kassi meenutustest selgub, et aktiivselt aitasid Põlvamaa jalgpallielule tookord kaasa veel Arvo Jää, Aivar Häelm ja Vassili Mahla.

80ndatel aastatel oli Põlva rajooni jalgpallielu vedajaks Põlva kolhoosi (rajooni meister 1981,1983,1985) ja Võhandu sovhoosi (rajooni meister 1982, 1987,1988,1989) võistkonnad. Kümnendi lõpu poole liitus nendega ka Põlva MEK (meister 1979, 1986, 1990) , mille koosseisus nuusutasid jalgpallihõngu ka tulevased Lootose asutajaliikmed Kaido Kukli, Indrek Käo ja Algis Asadov.

Põlvamaa jalgpalli 30 aastapäeva puhul ja auks, toimus 2009 aastal esmakordselt jalgpallimats XX sajand vs XXI sajand. Lootospargis kohtusid 30,oktoobril JK Lootose veteranid ja noored. XX sajandi võistkond väljendas Põlva JK Lootose loomislugu, XXI sajandi võistkond aga klubi edulugu ja tänast päeva.  XX sajandi meeskonnas mängisid Indrek Käo, Kaido-Meinhard Kukli, Ivan Mihnovitš, Elar Tarkus, Marko Lodjak, Bruno Rammo, Denis Pavlov, Enno Patrail, Ruve Reinson, Margus Nemvalts, Raul Hansen, Taavi Tobreluts, Sulev Kallavus, Veiko Kahar, Ander Konks, Romet Palmik, Rivo Reinson. XXI sajandi meeskonna koosseis: Mait Toom (JK Tammeka), Kaarel Kiidron (JK Tammeka), Alar Alve, Egon Kasuk, Tauri Kolk, Rauno Jõgeva, Kahru Kaasik, Tarvin Kaldvee, Henry Kõmägi, Janar Tamm, Lehar Savikink, Vladislav Mihnovitš, Kristjan Haan, Mikk Puustusmaa, Rene Sütt, Tanel Tusov, Rünno Villemson, Karel Olle. Mängu vaheajal toimus jalgpalliveteranide austamine. Tänati neid, kes olid Põlva jalgpallisünni juures.

Põlva maakonna (rajooni) meistrid

9 korda – FC Lootos – 2015, 2013, 2010, 2005, 2004, 2003, 2002, 2001, 2000
5 korda – Värska Vesi – 2011, 2009, 2008, 2007, 2006
4 korda – Võhandu sovhoos – 1989, 1988, 1987, 1982
3 korda – Põlva käsipalliklubi – 1999, 1998, 1997
3 korda – Põlva valla SK Serviti – 1996, 1995, 1994
3 korda – SK Serviti – 1993, 1992, 1991
3 korda – Põlva MEK – 1990, 1986, 1979
3 korda – Põlva kolhoos – 1985, 1983, 1981
2 korda – Värska Originaal – 2016, 2012
1 kord – Orava Sport – 2017
1 kord – FC Rosma – 2014
1 kord – Põlva EPT – 1984
1 kord – Põlva Rajooni Täitevkomitee – 1980

Põlva maakonna karikavõitjad (alates 2010 maakonna lahtised karikavõistlused)

2017 – Värska Originaal
2016 – Värska Originaal
2015 – Tõrvandi FC Helia Puit
2014 – Värska Originaal
2013 – Kuperjanovi JK
2012 – Everin Värska
2011 – Kuperjanovi ÜJP
2010 – Värska Vesi I
2009 – Värska Vesi
2008 – Värska Vesi
2007 – Ahja Sipelgas
2006 – Ahja IL
2005 – Värska
2004 – Kaitseliidu Põlva Malev
2003 – FC Rosma